Thèse Influence de l'Infection par Mycobacterium Tuberculosis sur les Capacités de l'Hôte à Contrôler une Surinfection Virale. H/F - 59

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Centre d'Infection et d'Immunité de Lille
Direction de la thèse : Arnaud MACHELART ORCID 0000000244440011
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

La tuberculose reste l'une des principales causes d'infection pulmonaire chez l'homme. On estime à 10 millions le nombre de personnes atteintes de tuberculose chaque année, avec environ 1,5 million de décès. De plus, Mycobacterium tuberculosis (Mtb) provoque une infection latente chez environ 25 % de la population mondiale. Les patients atteints de tuberculose latente sont capables de contenir l'agent infectieux à l'intérieur d'une structure cellulaire immunitaire bien organisée appelée le granulome. Durant sa thèse, le candidat développera un modèle in vitro et in vivo pour étudier la capacité de l'hôte infecté par Mtb à combattre la surinfection par les virus et à élucider les mécanismes sous-jacents de la surinfection virale dans ce modèle.
Pour ce faire, nous avons mis en place un modèle d'infection chronique chez la souris, qui mime un état de tuberculose latente. Les premiers résultats ont montré que ces souris contrôlent de manière significativement différentes l'infection par différentes espèces de virus pulmonaires en comparaison aux animaux non infectés par M. tuberculosis.
Après avoir renforcé ces observations, il sera nécessaire de caractériser le statut immunologique des souris co-infectées afin d'émettre des hypothèses pour expliquer le phénotype observé. Nous utiliserons la cytométrie en flux pour suivre en cinétique le recrutement cellulaire immunitaire dans les poumons. En parallèle, une analyse histologique (inflammation, hémorragie, nécrose, congestion) sera réalisée et l'expression des cytokine (IFN, IL-6, TNF, IL12p40) et des marqueurs associés aux fonctions de barrière épithéliale (occludine, Zo-1, Foxj1) sera quantifiée par RTqPCR et/ou ELISA.
Nous développerons aussi un modèle de co-infection in vitro (cellules épithéliales et macrophages) pour étudier nos observations aux niveaux subcellulaire et moléculaire. Ce projet pourra démontrer l'impact de la tuberculose latente sur les capacités de l'hôte à contrôler une surinfection, et nous permettre d'émettre des hypothèses quant à l'impact de l'éradication de la tuberculose sur la santé humaine.

La co-infection entre la tuberculose et les infections virales représente un contexte physiopathologique encore peu exploré, alors même que l'infection tuberculeuse latente ou active pourrait moduler les réponses immunitaires de l'hôte et ainsi influencer la progression des infections virales. La compréhension des interactions entre Mycobacterium tuberculosis et les agents viraux constitue donc un axe de recherche particulièrement pertinent. Au sein de l'unité, nous disposons d'une expertise solide sur les modèles expérimentaux de la tuberculose ainsi que des infections virales, offrant un cadre adapté pour aborder ces questions.