Thèse Identification des Cibles et du Mécanisme d'Action de Nouveaux Antiviraux Naturels et Dérivés de Synthèse Actifs Contre les Coronavirus Humains H/F - 59

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Centre d'Infection et d'Immunité de Lille
Direction de la thèse : Karin SERON ORCID 000000029667133X
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

La pandémie de COVID-19, causée par le SARS-CoV-2, a rappelé l'urgence d'identifier des composés antiviraux contre les coronavirus humains (HCoVs). Un projet interdisciplinaire préliminaire a permis d'identifier deux composés naturels isolés de plantes et un analogue (hémi)synthétique actifs contre les coronavirus SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV et HCoV-229E. Le principal objectif sera d'élucider le mécanisme d'action de trois molécules ayant des caractéristiques structurales communes et disposant d'une activité pan-coronavirus. Des résultats préliminaires de cinétique suggèrent que ces composés ciblent l'étape de réplication du SARS-CoV-2 et du HCoV-229E. Une attention sera donc d'abord portée sur la recherche de leurs cibles biologiques. Une approche pluridisciplinaire (virus résistants, identification des mutations, profilage protéomique et/ou transcriptomique différentiel, et « target fishing ») sera mise en oeuvre. Les cibles virales seront validées par des expériences de génétique inverse. Les cibles cellulaires identifiées seront validées par l'utilisation de siRNA ou Crispr-Cas9 afin tester l'effet de leur déplétion sur l'infection virale. Ce projet de thèse a pour ambition de cerner le mécanisme d'action de candidats médicaments ciblant la réplication des coronavirus afin d'une part d'obtenir une meilleure compréhension des mécanismes de réplication des HCoVs, et, d'autre part, de proposer de nouvelles pistes de traitement contre les HCoVs.

Le projet de thèse fait suite à des résultats obtenus dans le cadre d'un projet interdisciplinaire qui a identifié deux composés naturels isolés de plantes et un analogue (hémi)synthétique ayant une activité pan-coronavirus. Ce sont de nouveaux composés jamais identifiés comme ayant des activités antivirales. La recherche de leur cible est primordiale pour comprendre leur mécanisme d'action.

L'objectif est d'identifier de nouvelles cibles pour des antiviraux contre les HCoVs et de également de mieux comprendre les mécanismes de réplication de ces virus

Les méthodologies utilisées sont des techniques classiques de virologie moléculaire et cellulaire. La culture cellulaire, les techniques de virologie (qRT-PCR, Western blot, titres infectieux, activité luciférase), l'utilisation de siRNA ou de la technique Crispr-Cas9, seront utilisés dans ce projet.