Thèse Modélisation du Syndrome de Diamond-Blackfan chez le Poisson Zèbre pour une Prise en Charge Personnalisée des Patients Porteurs de Variants dans les Gènes Rpl17 ou Rpl26 H/F - 59

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Centre de Recherches en Cancérologie de Lille
Direction de la thèse : Pierre-Olivier ANGRAND ORCID 0000000295094796
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

Le syndrome de Diamond-Blackfan (SDB) est une pathologie congénitale rare caractérisée par une anémie, diverses malformations et une prédisposition accrue au cancer. Plus d'une vingtaine de gènes sont connus pour être impliqués dans le SDB suite à une mutation. Récemment, l'équipe RADEME (Clinique de Génétique, CHU Lille) a identifiée chez des familles de patients porteurs du SDB de nouvelles mutations dans les gènes RPL17 et RPL26 qui codent pour des protéines de la grande sous-unité du ribosome. Le sujet de thèse propose d'utiliser l'édition du génome par le système CRISPR/Cas9 afin de générer des lignées de poissons zèbres déficientes pour la fonction des gènes rpl17 et rpl26 avec deux objectifs principaux. Le premier est l'obtention de modèles du SDB pour mieux comprendre les mécanismes moléculaires de la pathologie et en particulier de la tumorigenèse pour une meilleure prise en charge des patients et la prévention de l'apparition des cancers chez les patients ayant un SDB. Le second objectif est le développement d'un test fonctionnel pour étudier la pathogénicité de nouveaux variants identifiés en clinique, chez les patients porteurs de mutations dans les gènes RPL17 et RPL26.

Le syndrome de Diamond-Blackfan (SDB, OMIM #105650), dont l'incidence annuelle est estimée à une naissance sur 150 000 dans les pays européens, se manifeste par l'association d'anomalies hématologiques et de malformations congénitales d'expressivité variable. L'insuffisance médullaire est inconstante mais peut être diagnostiquée dès la naissance ou dans la première année de vie. Plus de la moitié des patients SDB présentent un retard de croissance et des anomalies du développement dont les plus fréquentes sont des malformations crâniofaciales (séquence de Pierre Robin et fente palatine), des malformations du rayon radial, des malformations de l'appareil urogénital et/ou des malformations cardiaques. En outre, les patients SDB présentent une prédisposition accrue à développer des leucémies myéloïdes aigües ou d'autres cancers (notamment ostéosarcomes, cancers colorectaux).
Plus d'une vingtaine de gènes sont identifiés comme impliqués dans le SDB à la suite d'une mutation. A l'exception des gènes TSR2, GATA1 ou HEATR3, les gènes impliqués dans le SDB codent tous pour des protéines ribosomiques de la petite (RPS) ou de la grande (RPL) sous-unité du ribosome, classant ainsi ce syndrome parmi les ribosomopathies. Récemment, l'équipe RADEME (ULR7364, Maladie Rares du Développement Embryonnaire : Génétique, Régulation et Protéomique, Univ. Lille, Clinique de Génétique médicale Guy Fontaine, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille) a identifié dans des familles porteuses du SDB, de nouveaux variants dans les gènes RPL17 et RPL26 codant pour deux protéines distinctes de la grande sous-unité du ribosome.
Dans ce contexte, le projet de thèse porte sur la génération de lignées de poissons zèbres déficients pour la fonction des gènes rpl17 et rpl26 avec deux objectifs : (i) l'obtention de modèles du SDB afin de mieux comprendre les mécanismes moléculaires de la pathologie pour une meilleure prise en charge des patients et (ii) le développement d'un test fonctionnel pour étudier la pathogénicité de nouveaux variants identifiés en clinique dans les gènes RPL17 ou RPL26.

Des lignées de poissons zèbres déficients pour la fonction des gènes rpl17 et rpl26, seront générées dans deux objectifs : (i) l'obtention de modèles du SDB afin de mieux comprendre les mécanismes moléculaires de la pathologie pour une meilleure prise en charge des patients et (ii) le développement d'un test fonctionnel pour étudier la pathogénicité de nouveaux variants identifiés en clinique chez des patients porteurs de mutations dans les gènes RPL17 ou RPL26.

Le projet de thèse s'organise autour de 5 tâches dont certaines seront conduites de manière indépendante et en parallèle.
1. Génération de lignées de poissons zèbres déficients pour rpl17 et rpl26 par le système CRISPR/Cas9.
2. Caractérisation des lignées afin d'évaluer si les modèles miment les caractéristiques phénotypiques du SDB.
3. Etude de l'éventuel développement tumoral chez les poissons mutants.
4. Utilisation des modèles rpl17 et rpl18 afin de tester la réponse aux traitements contre l'anémie et d'identifier de nouvelles molécules.
5. Mise en place d'un test fonctionnel pour l'étude de variants dans les gènes RPL17 et RPL26 identifiés en clinique.