Thèse Rôle du Métabolisme Énergétique des Blastes dans la Leucémie Aiguë Myéloïde Biomarqueurs Métaboliques pour Affiner la Stratification Pronostique et Prédire la Réponse Thérapeutique. H/F - 59

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Centre de Recherches en Cancérologie de Lille
Direction de la thèse : Jerome KLUZA ORCID 0000000273461305
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

Dans la leucémie aiguë myéloïde (LAM), le métabolisme énergétique des blastes leucémiques pourrait jouer un rôle clé pour améliorer les stratégies thérapeutiques. Ce projet explore l'utilisation des profils métaboliques (OxPhos et glycolyse) comme biomarqueurs pronostiques et théranostiques. Les paramètres OCR et ECAR seront mesurés sur une cohorte multicentrique de patients et complétés par des analyses de cytométrie en flux utilisant des sondes fluorescentes pour évaluer la masse et le potentiel de membrane mitochondriale, dans le cadre des immunophénotypages cliniques. Ces analyses permettront de relier les états métaboliques aux caractéristiques immunophénotypiques des blastes et de mieux caractériser fonctionnellement les cellules souches, impliquées dans les rechutes. En parallèle, des signatures seront explorées par RNA-Seq pour identifier les voies moléculaires associées à la flexibilité métabolique et à la résistance thérapeutique. Les clusters génétiques identifiés permettront de définir de nouvelles cibles pour des stratégies thérapeutiques combinées. Ce projet s'inscrit dans une démarche de santé de précision, où les données métaboliques et transcriptomiques seront intégrées via des approches d'intelligence artificielle, combinées à la classification ELN, pour affiner la stratification des patients et mieux prédire les réponses aux traitements. S'appuyant sur le consortium national MITOLAM pour collecter les échantillons, ce projet associe laboratoires de recherche et services cliniques. Il permettra également d'élucider les mécanismes métaboliques soutenant la résistance aux chimiothérapies et aux thérapies comme le vénétoclax, ouvrant la voie à des traitements personnalisés.

(*) Comprendre le rôle du métabolisme énergétique des blastes dans la leucémie aiguë myéloïde (LAM)
(*) Étudier les profils métaboliques des blastes leucémiques et leur impact sur la progression de la maladie et la réponse aux traitements.
(*) Analyser les liens entre le métabolisme énergétique et les caractéristiques immunophénotypiques des blastes et des cellules souches leucémiques.
(*) Développer des biomarqueurs métaboliques pour affiner la stratification pronostique et la prédiction de la réponse aux traitements
(*) Identifier des signatures métaboliques associées aux différents sous-types de LAM.
(*) Corréler les profils OCR (Oxygen Consumption Rate) et ECAR (Extracellular Acidification Rate) avec les classifications existantes (ELN, cytogénétique, mutations spécifiques).
(*) Explorer les liens entre métabolisme et résistance thérapeutique
(*) Identifier des signatures moléculaires par RNA-Seq pour mieux comprendre les voies impliquées dans la flexibilité métabolique et la résistance aux traitements.
(*) Déterminer les mécanismes métaboliques expliquant l'échappement aux chimiothérapies classiques et aux thérapies ciblées, comme le vénétoclax.
(*) Intégrer les données métaboliques et transcriptomiques dans une approche de médecine de précision
(*) Utiliser l'intelligence artificielle pour combiner ces données avec la classification ELN et affiner la stratification des patients.
(*) Identifier des sous-groupes de patients susceptibles de mieux répondre à des stratégies thérapeutiques spécifiques.
(*) Développer de nouvelles cibles thérapeutiques basées sur les profils métaboliques et génétiques
(*) Tester des approches combinatoires pour inhiber les mécanismes métaboliques impliqués dans la résistance aux traitements.
(*) Traduire ces découvertes en applications cliniques pour améliorer la prise en charge des patients atteints de LAM
(*) Associer les laboratoires de recherche et les services cliniques pour assurer un transfert efficace des découvertes vers la clinique.

Un Projet à l'Interface de la Recherche Fondamentale et de l'Application Clinique: Ce projet s'inscrit dans une dynamique de recherche translationnelle, combinant des approches fondamentales et cliniques. Il repose sur une collaboration étroite entre un laboratoire de recherche spécialisé en métabolisme cellulaire et les services cliniques d'hématologie.

Caractérisation des profils métaboliques : Utilisation d'analyses OCR (Oxygen Consumption Rate) et ECAR (Extracellular Acidification Rate) pour étudier la dépendance des blastes leucémiques à la phosphorylation oxydative (OxPhos) et à la glycolyse.

Analyses de cytométrie en flux : Utilisation de sondes fluorescentes pour mesurer la masse mitochondriale et le potentiel membranaire des blastes, permettant une meilleure compréhension du rôle des mitochondries dans la résistance aux traitements.

Approches transcriptomiques : Exploration des signatures moléculaires associées aux différentes stratégies métaboliques des blastes et aux mécanismes de résistance via RNA-Seq.

Séquençage de l'ADN nucléaire et mitochondriale.