Thèse Caractérisation d'Un Nouveau Facteur de Transcription chez Plasmodium Falciparum Étude de son Rôle au Cours du Développement Intraérythrocytaire du Parasite H/F - 59

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Centre d'Infection et d'Immunité de Lille
Direction de la thèse : Christine PIERROT ORCID 0000000268356789
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

Le paludisme est causé par la prolifération du parasite Plasmodium au cours de cycles répétés de multiplication asexuée à l'intérieur des érythrocytes de l'hôte. Au cours de son développement asexué, le parasite modifie son transcriptome afin d'exprimer les gènes au moment précis où cela est nécessaire (on parle d'une transcription « juste à temps »). De plus, la régulation au niveau transcriptionnel est importante pour la progression du cycle de développement intra-érythrocytaire (IDC) du parasite et sa prolifération dans le sang de l'hôte.
Le génome des parasites Plasmodium possède un nombre limité de facteurs de transcription (FT) spécifiques d'une séquence. La plus grande famille est celle des protéines de la famille Apicomplexan AP2 (ApiAP2), qui sont homologues de la protéine végétale APETALA2/Ethylene Response Factor (AP2/ERF) et contiennent un à trois domaines de liaison à l'ADN appelés domaines AP2. Plusieurs TF ApiAP2 spécifiques de certains stades de Plasmodium ont été étudiés. Ainsi les FT ApiAP2 jouent un rôle primordial au niveau des stades sexués du parasite chez l'hôte définitif (Anophèle femelle). En ce qui concerne les stades asexués, deux activateurs transcriptionnels, PfAP2-I et PbSIP2, ont été décrits comme ayant un rôle activateur de la transcription aux stades trophozoïtes et schizonts (stades tardifs de développement). De plus, récemment, il a été démontré que PbAP2-TR jouait un rôle essentiel dans le développement des stades trophozoïtes de P. berghei en tant que répresseur transcriptionnel (Nishi 2026). Cependant, les facteurs de transcription qui contrôlent les changements transcriptomiques au cours des stades précoces du parasite n'ont pas encore été identifiés, et le mécanisme régulant les pics de transcription des gènes à ces stades reste largement inconnu.
Notre équipe possède une longue expérience dans la caractérisation des FT ApiAP2 de Toxoplasma gondii. T. gondii est un pathogène eucaryote unicellulaire appartenant, comme Plasmodium, au phylum Apicomplexa. Ce parasite partage avec Plasmodium une grande capacité de prolifération (tachyzoïte) et un cycle de vie caractérisé par des profils d'expression spécifiques à chaque stade. Au cours de nos études, nous avons pu identifier un nouveau domaine de liaison à l'ADN présent dans les protéines de T. gondii, domaine qui est également conservé chez certaines protéines de Plasmodium. Parmi celles-ci, une protéine est prédite pour être essentielle pour le développement intra-érythrocytaire de Plasmodium et est exprimée à des niveaux maximaux au cours des stades précoces du développement. L'objectif de ce projet sera de caractériser cette protéine et d'étudier son rôle dans la régulation de l'expression des gènes de Plasmodium falciparum. Plus particulièrement, nous étudierons le rôle de ce nouveau domaine de liaison à l'ADN. La caractérisation fonctionnelle sera réalisée grâce à la production de lignées transgéniques knock-out inductibles.

Ce projet de thèse s'inscrit dans une des thématiques de l'équipe Biologie Intégrative des parasites apicomplexes' visant à étudier la régulation du cycle cellulaire chez Plasmodium et Toxoplasma.
Plus particulièrement, notre équipe a caractérisé un facteur de transcription chez T. gondii et montré son rôle dans le cycle cellulaire du tachyzoite et la génération des cellules filles. La protéine sélectionnée chez Plasmodium et faisant l'objet de ce projet contient un domaine conservé avec le facteur de transcription de T.gondii, impliqué dans sa liaison avec l'ADN. La conservation de la structure 3D prédite de ce domaine suggère fortement qu'il puisse interagir avec l'ADN de Plasmodium et réguler l'expression de gènes cruciaux pour le parasite.
Nous proposons, par des approches de génétique inverse, d'explorer la fonction précise de cette protéine chez Plasmodium.

Culture cellulaire (Plasmodium falciparum)
Microscopie confocale
RNA-Seq
Production de protéines recombinantes
Pull down / Turbo-ID / MS (in collaboration)
Biologie moléculaire (design de constructions, pcr, analyse de séquences)